重大科技創新是大規模有組織的科技創新活動，能夠集中力量進行科技攻關，解決國家經濟和社會發展中的重大問題，對于增強國家的科技實力、經濟實力和綜合國力具有重要作用。《中共中央關于進一步全面深化改革、推進中國式現代化的決定》提出：“優化重大科技創新組織機制”。這是完善科技管理工作的一項重要改革舉措，將進一步提高科技創新的效能，更好保障重大科技創新的順利實施。

第一，優化組織機制是完成重大科技創新的必要保障。新一輪科技革命和產業變革突飛猛進，科學研究范式發生深刻變革，科研活動復雜性顯著增加。重大科技創新具有前沿性、引領性、顛覆性等特點，投入大、風險高、周期長，是系統性社會化大生產的一種形式，必須要有強大的組織機制。同時，我國科技事業發展迅速，科技創新由原來的學習型、追趕型逐漸轉變為并跑型、引領型，迫切需要優化重大科技創新組織機制，以適應科技發展趨勢和我國科技創新工作的需要。特別是中央科技委員會成立后，科技領導體制和管理機制發生重大變化。加強黨中央對科技工作的集中統一領導，發揮對重大科技創新組織者作用，強化國家層面的統籌和布局并組織推動實施，需要進一步優化重大科技創新組織機制。優化組織機制，有利于發揮社會主義制度集中力量辦大事的優勢，集聚戰略科技力量，調動重要創新資源，保障重大科技創新順利實現戰略目標。

第二，優化組織機制有利于提高重大科技創新的效能。重大科技創新需要大量創新資源，而創新資源是相對稀缺的。優化組織機制，發揮好市場配置資源的決定性作用和政府的組織協調作用，建立符合科技創新規律的資源配置模式，有利于提高資源配置效率，把好鋼用在刀刃上，實現科技創新效益最大化。重大科技創新往往涉及多個部門、領域、團隊和學科，優化組織機制，有利于增強創新協同性。針對不同創新任務形式，采取不同的管理模式，完善“揭榜掛帥”、“賽馬”制、“業主制”等方式，建立起適宜的組織模式，可以系統地提升創新效率。通過優化組織機制，可以進一步促進科技產業的融合，增強科技創新對產業和經濟的源頭供給能力，加快成果轉化，盡快形成新質生產力。

第三，優化組織機制必須解決好重大科技創新實施中的突出問題。當前我國重大科技創新實施中還存在國家戰略需求和市場需求轉化為重大科技任務的機制不健全，多元化資源配置格局尚未形成，戰略科技力量組織動員以及產學研、部門間、領域間的協同不夠等問題，亟待通過優化組織機制解決。一是加強統籌布局，完善需求導向和問題導向的國家重大科技任務選題方式，建立將企業、地方符合國家戰略需求的項目納入國家科技計劃體系的選擇機制。二是完善科技創新全鏈條聯動機制，建立科技創新重點領域一體規劃和部署機制，統籌部署創新鏈、產業鏈、人才鏈、資金鏈，建立貫穿全鏈條的多部門聯動實施、接力實施工作機制。三是探索建立重大科技任務分類管理組織模式，針對不同領域、目標和特點，選擇合適的部門、地方、總承單位和業主單位負責實施。四是加快轉變科技資源配置方式，探索建立市場驅動的關鍵核心技術突破機制，實現政府有為、市場有效、創新主體有擔當的有機統一。五是強化任務實施督查、動態調整和考核驗收，設置里程碑節點，引入科技項目監理機制，強化對主責單位、專業機構監督管理。同時，發揮社會監督作用，形成內部管理與社會監督相互促進的管理模式。